一是知行结合不够。这是高校校园文化建设存在的主要问题，突出地表现在过分注重功利主义。从理论上普遍认识到校园文化在学校教育中的地位、功能和作用，很多高校能把校园文化建设纳入到学校建设发展的总体规划中，提出校园文化建设目标，但在实际操作中注重校园物质文化建设，忽视校园精神文化建设，普遍存在着知行脱节问题，以至于体制、机制上不健全，工作上不协调，效率不高，影响校园文化建设的健康发展和实际效果。
二是认识存在误区。首先，把校园文化只看成是学生的文化、学工部门的文化。其次，对教师在校园文化中的地位和作用的认识和重视不够，对教师作为青年学生榜样和引导者在青年学生成长成熟过程中能起到的重要作用认识不够;其三，对师生的主体性作用不够重视，对师生积极主动参与校园文化建设支持、引导不够。
三是投入相对滞后。高校在校园文化建设中的投入相对处于滞后状态，无法满足师生员工日益增长的文化需要，不能充分发挥校园文化的各项功能。
四是特色不够鲜明。利用网络文化促进校园文化建设不够，对师生文明上网的教育和引导乏力，缺少自由、真实交流和沟通的平台，在信息收集处理、科研辅助、学习辅导等方面做得不够。校园文化活动品牌意识不够，品牌形象没有树起来，缺乏在师生中叫得响、作用大的大众活动，缺少在社会上影响大的品牌活动。
